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    我國 AI 農業育種平臺登頂刊,號稱遺傳學分析加速 1000 倍

    來源:皇冠體彩 發表時間 :2024-03-31 12:55:04

    感謝IT之家網友 lemon_meta 的業育遺傳線索投遞!

    IT之家 3 月 21 日消息,種平近日,臺登全球植物科學頂尖期刊《分子植物》(Molecular Plant)刊載了中國科學家的頂刊最新研究,中國農業科學院作物科學研究所、學分析加國家南繁研究院與阿里達摩院聯合研發出全流程智慧育種平臺,速倍實現了育種數據管理和分析、業育遺傳計算加速、種平AI 預測親本及優良品種的臺登育種全流程整合。

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    該平臺的學分析加數據容量、運行速度以及數據安全號稱“達到世界先進水平”,速倍全球已有 23 家科研機構率先使用。業育遺傳

    論文共同一作兼通訊作者李慧慧介紹說,種平種子是臺登農業的“芯片”,對農業發展至關重要,但傳統育種方式成本高、工作量大,往往需要耗時十年甚至更久。在 AI 等技術加持下,“智慧育種”可通過模擬作物生長氣候、土壤及生長周期等信息,綜合作物表型、基因型等數據建立模型,進而預測作物性狀、篩選優異基因型,大幅縮短育種周期。

    不過,智慧育種需要高通量數據分析,依賴龐大的計算和建模、復雜的操作,對育種家挑戰很大。中國農業科學院作物科學研究所、國家南繁研究院與達摩院融合生物技術和 AI 技術,合作開發出高通量計算平臺,在網頁端為育種家提供“一站式、低門檻”的服務。

    具體而言,該平臺整合了種質資源信息管理、育種試驗設計與模擬、海量育種組學數據存儲、高通量數據分析以及智能育種決策等模塊,支持大規模組學信息、表型信息數據的整合利用與深度挖掘。

    數據顯示,該平臺已被全球 23 家科研機構用于育種研究,包括中國水稻研究所、中國科學院遺傳與發育生物學研究所、國際畜牧研究所、荷蘭瓦格寧根大學等。

    為加速育種決策運算,智慧育種平臺引入多種大數據計算、人工智能模型、自動化處理模塊。論文通訊作者、達摩院智慧育種科學家顧斐介紹,平臺實現針對基因測序數據的變異位點計算加速 110 倍,基因型過濾加速 25 倍以上,群體遺傳學分析加速 1000 倍以上。

    針對全基因組選擇算法,平臺的準確率平均提升 15% 以上,預測穩定性提升 5%。此外,該平臺數據存儲容量達 1PB,可支持上百個用戶同時開展高效的育種大數據管理、調度和分析。

    IT之家附論文鏈接:
    https://www.cell.com/molecular-plant/fulltext/S1674-2052(24)00075-3

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